En biologie, pour décrire un organisme particulier, qui appartient aux règnes des animaux, des champignons ou des plantes, sa propre nomenclature a été développée. Il reflète l'appartenance à une espèce, en fonction des caractéristiques de morphologie et d'apparence. Pour les animaux, les critères de référence à une espèce sont appliqués, en fonction de la capacité à produire une progéniture fertile lors de la fécondation. Cependant, ces modèles ne s'appliquent qu'à ces organismes, alors que les microbes ne peuvent pas être classés de cette manière.
Le concept de souche en microbiologie
En raison de la présence d'un grand nombre d'organismes qui ont des propriétés morphologiques, mais des caractéristiques biochimiques et immunologiques différentes, il est impossible d'appliquer une nomenclature standard pour la dénomination. En conséquence, un tel concept de souche a été introduit. Il s'agit d'une culture pure de microbes qui a été isolée et isolée à un certain endroit à une certaine heure.
Chaque microbe appartenant à une souche est similaire à un autre représentant de ce type en termes de critères biochimiques, morphologiques, immunologiques et génétiques. Mais au sein d'une même espèce bactérienne, une telle analogie n'est pas observée. Par conséquent, une souche est un nom plus flexible pour une culture microbienne. Parce que vitel'échange de matériel génétique (mutation) conduit à l'émergence de nouveaux organismes au sein d'une espèce, mais avec des propriétés différentes, c'est cette définition qui permet de caractériser plus précisément les facteurs de pathogénicité et de virulence.
Souches bactériennes
La nomenclature existante des bactéries permet de classer les types d'organismes, mais ne caractérise pas leurs nouvelles propriétés. Ces derniers apparaissent à la suite d'une mutation rapide, acquérant de nouvelles propriétés, notamment celles pathogènes pour l'homme, les animaux d'élevage et les plantes, ainsi que d'autres microbes. Un exemple de nomenclature utilisant l'exemple d'Escherichia coli ressemble à ceci: règne - bactérie, type - Proteobacteria, classe de gamma-protéobactéries, ordre - Enterobacteriales, famille d'Enterobacteria. Le genre est Escherichia et l'espèce est Escherichia colli. Cependant, il existe de nombreuses cultures de bactéries de l'espèce Escherichia colli, présentant des propriétés différentes. Ils sont isolés dans des souches de bactéries distinctes et portent un nom supplémentaire. Par exemple, Escherichia colli O157:H7.
E. coli lui-même est présent dans l'intestin humain et ne provoque pas de maladie, mais la souche O157:H7 est exclusivement pathogène en raison de la présence d'un grand nombre de facteurs de virulence. Elle a connu une épidémie de maladies entérotoxinogènes au cours des 5 dernières années.
Souches virales
Le concept de souche est un nom flexible pour des organismes ayant les mêmes propriétés qui ont été isolés, puis identifiés et décrits dans une certaine zone à un certain moment. Avec son évolution, le virus peut acquérir de nouvelles propriétés dues à des propriétés antigéniquesdérive. Cela créera une nouvelle souche virale, peut-être plus pathogène que son parent.
Vous pouvez clairement montrer l'émergence de nouvelles souches en utilisant l'exemple du virus de la grippe. Il appartient à la famille des Orthomyxovirus et est nommé en fonction des antigènes (hémagglutinines et neuraminidase) HxNy. X et Y sont des valeurs numériques traduisant la présence d'antigènes. Un exemple est H5N1, connu pour la récente épidémie de grippe porcine avec des pneumonies hémorragiques rapidement progressives. Selon la théorie, une nouvelle souche plus dangereuse peut se développer à partir de cette souche en raison de la même dérive antigénique.
Souches fongiques et souches protistes
Les moisissures sont les microbes les moins variables, bien que leur biochimie soit également complexe. En raison d'une structure plus complexe que les bactéries et les virus, et également en raison de l'absence de mécanismes de transfert rapide de gènes, le nombre de nouvelles souches fongiques augmente légèrement. Il existe également une opinion selon laquelle toute souche fongique nouvellement découverte est un organisme préexistant qui n'a tout simplement pas été découvert par les chercheurs.
Une situation similaire existe au royaume des protistes. Leur capacité à muter est faible, de sorte que la probabilité que de nouvelles souches apparaissent rapidement est extrêmement faible. Cependant, de nouvelles variantes d'organismes de la même espèce apparaissent encore. Par conséquent, apparemment, ils existaient également plus tôt, mais n'ont pas été découverts.
